SHY: Tokyo Dakkan-hen

Shy ha madurado un poco tras luchar contra los 'Amalareik', liderados por el misterioso chico Stigma. Cuando regresa a Japón, conoce a una chica llamada Ai Tennouji que ha huido de su aldea ninja. Ai le cuenta a Shy que dejó la aldea para perseguir a un miembro de los 'Amalareik'. Mientras tanto, ocurre un incidente en el que Tokio queda de repente envuelta en una bola negra y desaparece. Los héroes son enviados para rescatar Tokio.